The Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes (PCAWG) telah menyatukan lebih dari 1.300 ilmuwan untuk mendapatkan wawasan baru tentang genetika kanker. Sebagai bagian dari upaya itu, para peneliti sekarang telah melakukan survei terhadap virus yang dapat ditemukan pada berbagai jenis kanker.

Dengan menggunakan data genetik yang diperoleh dari sekitar 38 jenis 2.600 tumor kanker, para ilmuwan mengungkapkan keberadaan DNA virus dalam tiga belas persen di antaranya; jejak 23 jenis virus yang berbeda ditemukan dalam sampel dari 356 pasien kanker. Seperti yang diharapkan, driver virus yang dikenal tumor adalah yang paling umum. Para peneliti juga belajar lebih banyak tentang mekanisme yang digunakan virus untuk mengaktifkan mutasi genetik yang mendorong kanker.

223501 web 1024x855 - Adakah Hubungan Antara Virus dan Kanker ?
Kredit gambar: Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes

“Kami sudah tahu beberapa hubungan kuat antara infeksi dan kanker. Misalnya, kehadiran Helicobacter pylori di saluran pencernaan dapat menyebabkan tukak lambung dan dikaitkan dengan kanker perut,” kata Dr. Daniel Brewer, dari Universitas East Anglia. Sekolah Kedokteran Norwich dan Pekerja Tamu di Earlham Institute (EI). “Sementara itu beberapa jenis virus HPV dapat menyebabkan kanker serviks.”

Jika sampel jaringan manusia mengalami sekuensing seluruh genom, DNA virus yang mungkin menginfeksi sel-sel dalam sampel itu juga akan diurutkan. “Ini telah memberi kami peluang fantastis untuk mengumpulkan data guna menemukan hubungan baru antara virus dan berbagai jenis kanker,” kata Brewer. “Ini adalah pertama kalinya sebuah studi sistematis tentang mayoritas jenis kanker untuk virus telah dibuat. Hal ini penting karena menemukan hubungan baru antara infeksi dan jenis kanker memiliki potensi untuk menyediakan vaksin, seperti vaksin HPV, yang dapat mengurangi dampak global dari kanker. “

Para ilmuwan telah mengidentifikasi sebelas mikroba infeksius yang dapat menyebabkan kanker, termasuk Hepatitis B dan C, Virus Epstein-Barr, Helicobacter pylori, dan beberapa jenis human papillomavirus (HPV). HPV sendiri menyebabkan sekitar 640.000 kasus kanker setiap tahun. Dalam karya ini, para peneliti mencari virus karsinogenik yang dikenal dan tidak diketahui. Virus Epstein-Barr (EBV), yang dapat menyebabkan beberapa jenis kanker termasuk kanker lambung dan nasofaring, terdapat pada 5,5 persen sampel, sedangkan Hepatitis B ada dalam delapan belas persen dari sampel kanker hati.

“Masalah yang terkait virus dengan kanker sangat relevan dalam kedokteran karena, pada kanker terkait virus, pencegahan nyata adalah mungkin,” kata Dr. Marc Zapatka dari German Cancer Research Center (DKFZ). “Jika virus karsinogenik diidentifikasi, ada kemungkinan untuk menghindari infeksi dengan vaksin untuk mencegah kanker berkembang.”

HPV ditemukan pada 19 dari 20 sampel kanker serviks dan 18 dari 57 sampel tumor kepala dan leher. Mereka juga menemukan bahwa adenovirus dan baculovirus tidak terkait dengan kanker.

“Kami menemukan bahwa keberadaan HPV adalah saling eksklusif untuk beberapa perubahan penting yang terlihat pada kanker kepala dan leher, yang berarti bahwa virus HPV dapat membantu kanker berkembang tanpa perubahan tambahan pada genomnya,” kata Brewer.

Beberapa virus lain ditemukan yang diketahui menyebabkan kanker, seperti retrovirus pada kasus kanker ginjal dan cytomegalovirus dalam sampel kanker lambung. Virus ditemukan berintegrasi ke dalam genom sel inang mereka dalam banyak kasus, yang tampaknya mendorong mutasi.

“Kami juga menemukan bahwa keberadaan virus dalam tumor dikaitkan dengan pola perubahan genom yang telah dikaitkan dengan mekanisme perbaikan kerusakan DNA yang rusak dalam sel manusia. Ini menunjukkan peran gangguan pertahanan antivirus sebagai kekuatan pendorong dalam karsinoma serviks, kandung kemih dan kepala-dan-leher, “tambah Brewer.

“Ketika menganalisis seluruh genom kanker, kami menemukan jejak virus pada tumor yang jauh lebih banyak daripada studi sebelumnya yang hanya berdasarkan penelitian RNA. Namun, kami tidak dapat mengkonfirmasi spekulasi umum bahwa virus lain, yang belum diketahui terkait dengan kanker, “kata Profesor Peter Lichter dari DKFZ. “Namun, dalam banyak kasus, kita sekarang memiliki gagasan yang lebih jelas tentang bagaimana patogen menyebabkan mutasi ganas dalam sel.”

Sumber: AAAS / Eurekalert! melalui Universitas East Anglia , Nature Genetics

ARTIKEL TERKAIT

LEAVE A REPLY

Please enter your comment!
Please enter your name here