Home Kesehatan COVID-19 : Apakah Coronavirus Baru Lebih dari Satu Jenis ?

COVID-19 : Apakah Coronavirus Baru Lebih dari Satu Jenis ?

71
0

Sejak munculnya coronavirus baru, yang disebut SARS-CoV-2, beberapa peneliti telah mengusulkan bahwa ada lebih dari satu jenis, dan mutasi telah menyebabkan perubahan pada seberapa infeksi dan mematikannya. Namun, opini ini diperdebatkan.

GettyImages 1218139038 1024x683 1 - COVID-19 : Apakah Coronavirus Baru Lebih dari Satu Jenis ?
Apakah ada lebih dari satu jenis SARS-CoV-2?

Mutasi genetik adalah fenomena alami sehari-hari. Mereka dapat terjadi setiap kali materi genetik disalin.

Ketika virus bereplikasi di dalam sel yang telah terinfeksi, segudang salinan baru akan memiliki perbedaan kecil. Mengapa ini penting?

Ketika mutasi mengarah pada perubahan dalam bagaimana suatu virus berperilaku, itu dapat memiliki konsekuensi yang signifikan. Ini tidak harus harus merugikan inang (host), tetapi dalam kasus vaksin atau obat yang menargetkan protein virus tertentu, mutasi dapat melemahkan interaksi ini.

Sejak kemunculan SARS-CoV-2, beberapa penelitian telah menyoroti variasi dalam urutan genetik virus. Ini telah mendorong diskusi tentang apakah ada beberapa jenis, apakah ini berdampak pada seberapa mudah virus dapat menginfeksi inang, dan apakah ini mempengaruhi atau tidak berapa banyak lagi orang yang akan meninggal.

Banyak ilmuwan telah menyerukan kehati-hatian. Dalam Fitur Khusus ini, kami merangkum apa yang saat ini diketahui para peneliti tentang mutasi SARS-CoV-2 dan mendengar dari para ahli tentang pandangan mereka tentang apa artinya ini bagi pandemi.

Mengapa mutasi penting?

SARS-CoV-2 adalah virus RNA yang diselimuti, yang berarti bahwa materi genetiknya dikodekan dalam RNA untai tunggal. Di dalam sel inang, ia membuat mesin replikasi sendiri.

Virus RNA memiliki tingkat mutasi yang sangat tinggi karena enzim replikasi mereka rentan terhadap kesalahan ketika membuat salinan virus baru.

Ahli virologi Prof. Jonathan Stoye, seorang pemimpin kelompok senior di Francis Crick Institute di London di Inggris, mengatakan kepada Medical News Today apa yang membuat mutasi virus signifikan.

“Mutasi adalah perubahan dalam urutan genetik,” katanya. “Fakta dari perubahan mutasi bukanlah yang utama, tetapi konsekuensi fungsionalnya.”

Jika perubahan genetik tertentu mengubah target obat atau antibodi yang bertindak melawan virus, partikel-partikel virus dengan mutasi akan lebih besar daripada yang tidak memilikinya.

“Perubahan protein untuk memungkinkan masuknya virus ke dalam sel yang membawa jumlah protein reseptor yang sangat rendah juga dapat memberikan keuntungan pertumbuhan bagi virus,” tambah Prof. Stoye.

“Namun, harus ditekankan bahwa hanya sebagian kecil dari semua mutasi yang akan menguntungkan; sebagian besar akan netral atau berbahaya bagi virus dan tidak akan bertahan. “

“Mutasi pada virus jelas penting, sebagaimana dibuktikan dengan kebutuhan untuk menyiapkan vaksin baru terhadap virus influenza setiap tahun untuk pencegahan efektif flu musiman dan kebutuhan untuk mengobati HIV-1 secara bersamaan dengan beberapa obat untuk mencegah munculnya virus resisten. “

– Prof. Jonathan Stoye

Peneliti menemukan mutasi

Sebuah studi penelitian oleh tim dari Arizona State University di Tempe menggambarkan mutasi yang meniru peristiwa serupa yang terjadi selama epidemi SARS pada tahun 2003.

Tim mempelajari lima sampel usap hidung yang memiliki hasil tes SARS-CoV-2 yang positif. Mereka menemukan bahwa salah satu dari ini memiliki penghapusan, yang berarti bahwa sebagian genom virus hilang. Tepatnya, 81 nukleotida dalam kode genetik virus telah hilang.

Penelitian sebelumnya menunjukkan bahwa mutasi serupa menurunkan kemampuan virus SARS untuk bereplikasi.

Studi lain, kali ini dalam Journal of Translational Medicine , mengusulkan bahwa SARS-CoV-2 telah mengambil pola mutasi spesifik di wilayah geografis yang berbeda.

Para peneliti, dari University of Maryland di Baltimore dan perusahaan biotek Italia Ulisse Biomed di Trieste, menganalisis delapan mutasi berulang pada 220 sampel pasien COVID-19.

Mereka menemukan tiga di antaranya secara eksklusif dalam sampel Eropa dan tiga lainnya secara eksklusif dalam sampel dari Amerika Utara.

Studi lain , yang belum melalui proses peer review, menunjukkan bahwa mutasi SARS-CoV-2 telah membuat virus lebih menular dalam beberapa kasus.

Dalam makalahnya, Bette Korber – dari Laboratorium Nasional Los Alamos di New Mexico – dan kolaborator menggambarkan 13 mutasi di wilayah genom virus yang mengkode protein lonjakan.

Protein ini sangat penting untuk infeksi, karena membantu virus mengikat sel inang.

Para peneliti mencatat bahwa satu mutasi tertentu, yang mengubah asam amino dalam protein lonjakan, “mungkin berasal baik di Cina atau Eropa, tetapi [mulai] menyebar dengan cepat pertama di Eropa, dan kemudian di bagian lain dunia, dan yang sekarang merupakan bentuk pandemi dominan di banyak negara. “

Stoye berkomentar bahwa hasil penelitian ini, dalam beberapa hal, tidak mengejutkan.

“Virus biasanya disesuaikan dengan spesies inangnya. Jika mereka melompati spesies, misalnya, dari kelelawar ke manusia, tingkat retuning tidak terhindarkan baik untuk menghindari pertahanan inang alami maupun untuk interaksi optimal dengan sel inang baru, ”katanya.

“Mutasi acak akan terjadi, dan virus yang paling cocok akan mendominasi,” tambahnya. “Oleh karena itu, tidak mengherankan bahwa SARS-CoV-2 berkembang mengikuti lompatannya ke, dan menyebar melalui, populasi manusia. Jelas, perubahan seperti ini sedang terjadi, sebagaimana dibuktikan oleh penyebaran [mutasi] yang diamati oleh Korber [dan rekan]. ”

Namun, Prof. Stoye tidak berpikir bahwa pada titik ini jelas bagaimana mutasi akan mendorong perilaku SARS-CoV-2 dalam jangka panjang.

“Kekhawatiran tentang evolusi SARS-CoV-2 untuk menolak vaksin dan obat yang masih dikembangkan tidak masuk akal,” jelasnya. “Namun demikian, juga memungkinkan bahwa kita akan melihat evolusi ke versi virus yang kurang berbahaya, seperti yang mungkin terjadi setelah kolonisasi manusia awal oleh apa yang disebut coronavirus musiman.”

Pendapat tetap terbagi 

Awal tahun ini, para peneliti dari Universitas Peking di Beijing, Cina, menerbitkan sebuah makalah di National Science Review yang menggambarkan dua garis keturunan yang berbeda dari SARS-CoV-2, yang mereka sebut “S” dan “L.”

Mereka menganalisis 103 sampel urutan virus dan menulis bahwa sekitar 70% dari garis keturunan L.

Namun, sebuah tim di Pusat Penelitian Virus di Universitas Glasgow di Inggris tidak setuju dengan temuan ini dan menerbitkan kritik mereka terhadap data dalam jurnal Virus Evolution .

“Mengingat dampak dari klaim ini dan liputan media yang intens dari jenis artikel ini, kami telah memeriksa secara detail data yang disajikan […] dan menunjukkan bahwa kesimpulan utama dari makalah itu tidak dapat dibuktikan,” tulis para penulis.

David Robertson, kepala Genomik Viral dan Bioinformatika di Pusat Penelitian Virus, adalah bagian dari tim. MNT menanyakan pandangannya tentang kemungkinan ada lebih dari satu jenis SARS-CoV-2.

“Sampai ada beberapa bukti perubahan dalam biologi virus, kita tidak bisa mengatakan bahwa ada jenis virus baru. Sangat penting untuk menghargai bahwa mutasi adalah produk sampingan normal dari replikasi virus dan bahwa sebagian besar mutasi yang kami amati tidak akan berdampak pada biologi atau fungsi virus, ”katanya.

“Beberapa laporan, misalnya, perubahan asam amino pada protein spike menarik, tetapi saat ini, ini adalah hipotesis terbaik. Dampak potensial mereka saat ini sedang diuji di sejumlah laboratorium. “

Prof Stoye berpendapat bahwa ini “lebih merupakan kasus semantik daripada apa pun” saat ini.

“Jika kita memiliki urutan yang berbeda, kita memiliki strain yang berbeda. Hanya ketika kita memiliki pemahaman yang lebih besar tentang konsekuensi fungsional dari perubahan evolusioner yang diamati, masuk akal untuk mengklasifikasi isolat yang berbeda, ”katanya.

“Pada titik itu, kita dapat mencoba untuk mengkorelasikan variasi urutan dengan implikasi prognostik atau terapeutik. Ini mungkin memakan waktu beberapa tahun. “

Serotipe dan penelitian masa depan

Jadi, bukti apa yang dicari para ilmuwan skeptis dalam debat seputar beberapa jenis SARS-CoV-2?

MNT meminta Prof. Mark Hibberd, dari London School of Hygiene dan Tropical Medicine di Inggris, untuk mempertimbangkan perdebatan tersebut.

“Untuk ahli virus, ‘strain‘ adalah kata yang subjektif yang tidak selalu memiliki makna spesifik yang jelas,” komentarnya.

“Lebih berguna dalam situasi SARS-CoV-2 akan menjadi ide ‘serotipe,’ yang digunakan untuk menggambarkan strain yang dapat dibedakan dengan respon imun manusia – respon imun terhadap satu serotipe biasanya tidak akan melindungi terhadap serotipe yang berbeda . Untuk SARS-CoV-2, belum ada bukti konklusif bahwa ini telah terjadi. “

“Untuk menunjukkan bahwa virus telah berubah secara genetik untuk membuat respon imun yang berbeda, kita perlu mengkarakterisasi perlindungan kekebalan dan menunjukkan bahwa itu bekerja untuk satu serotipe dan bukan untuk yang lain,” lanjutnya.

Hibberd menjelaskan bahwa para ilmuwan sedang mempelajari antibodi penetral untuk membantu mereka menentukan serotipe untuk SARS-CoV-2. Antibodi ini dapat mencegah virus menginfeksi sel inang, tetapi mereka mungkin tidak efektif melawan strain baru.

“Beberapa kelompok di seluruh dunia telah mengidentifikasi mutasi spesifik pada protein lonjakan SARS-CoV-2, dan mereka khawatir mutasi ini dapat mengubah jenis pengikatan ini, tetapi kita tidak dapat memastikannya melakukan hal itu pada saat ini. Kemungkinan besar, mutasi ini kemungkinan akan mempengaruhi virus yang berikatan dengan reseptornya […], yang mungkin mempengaruhi transmisi.

– Prof. Mark Hibberd

“Kami idealnya membutuhkan bukti eksperimental, [seperti] demonstrasi mutasi yang mengarah ke perubahan fungsional pada virus pada contoh pertama, dan kedua demonstrasi bahwa perubahan ini akan berdampak pada [orang dengan infeksi],” Prof Saran Robertson.

Dia menunjuk pelajaran yang dipelajari para ahli selama wabah Ebola 2014-2018 di Afrika Barat, di mana beberapa kelompok penelitian telah menyarankan bahwa mutasi telah menyebabkan virus menjadi lebih mudah ditularkan antara orang-orang dan lebih mematikan.

Eksperimen kultur sel menunjukkan bahwa virus yang bermutasi mampu bereplikasi lebih cepat. Namun, ketika para ilmuwan kemudian mempelajari ini dalam model hewan , mereka menemukan bahwa itu tidak berperilaku berbeda dari noda tanpa mutasi.

Para ilmuwan di seluruh dunia terus mencari jawaban atas banyak pertanyaan luar biasa seputar SARS-CoV-2. Tidak diragukan lagi, kita akan melihat lebih banyak penelitian muncul dalam beberapa bulan dan tahun mendatang yang akan menilai dampak mutasi SARS-CoV-2 pada pandemi COVID-19 dan masa depan coronavirus baru ini.

printfriendly button - COVID-19 : Apakah Coronavirus Baru Lebih dari Satu Jenis ?

LEAVE A REPLY

Please enter your comment!
Please enter your name here